A motoros rendszer szerveződésére és működésére hierarchikus szerveződés jellemző: a mozgatórendszer struktúrái hierarchikusan szerveződnek (5. ábra), a magasabb központok bonyolultabb feldolgozást végeznek, és befolyásolják az alacsonyabb központok működését. A hierarchikus jelleg az evolúciónak tulajdonítható: az alá- és fölérendeltség mellett szükségszerű a központok közötti együttműködés. Ezen felül egy ún. párhuzamos feldolgozás is jellemző az izomrendszerre:több, párhuzamosan működő motoros alegység eltérő feladatok végrehajtására specializálódott. A kettő eredője határozza meg a végrehajtó szerveket, jelen esetben a vázizmokat csak a gerincvelői és agytörzsi agyidegmagvakban lévő motoneuronokon keresztül lehet elérni.

5. ábra: A mozgatórendszer hierarchikus struktúrarendszere és mozgásirányító rendszerein